En effet, explorer de façon exacte et quantitative la variation morphologique au sein des assemblages fossiles nécessite des méthodes analytiques appropriées. À travers l’utilisation des techniques d’imagerie, la construction de jumeaux numériques 3D à partir d’objets réels a ouvert la possibilité de développer des protocoles innovants pour l’analyse in silico des patrons de variations des os et dents des primates fossiles. En particulier, la morphométrie géométrique par points repères est à l’origine d’un changement méthodologique radical dans la discipline et de découvertes majeures. Cependant, dans certains cas (par ex. structures complexes et lisses, caractères discrets), la morphométrie géométrique par points repères n’est pas capable de saisir l’ensemble des différences morphologiques.